基因组检测可以帮助医生在卵巢癌患者的治疗决策过程中，然而，随着这些平台越来越商业化，医生也必须了解每种检测方法之间的异同.
Shannon Westin，MD
医生越来越了解基因组检测在指导卵巢癌患者治疗决策过程中的益处。然而，随着越来越多的这些平台投入商业使用，他们还必须了解这些测试之间的相似性和差异，Shannon N.Westin，MD，MPH，在2019年SGO冬季年会上的陈述中解释。1
FDA于2017年11月批准了一个CDx作为多种实体瘤类型的辅助诊断。同时，FDA还批准了MSK-IMPACT，这是由纪念斯隆·凯特林癌症中心开发的468基因检测方法。其他几个基因组测试平台已经上市，每个平台都有自己的优点、缺点和独特的功能。
威斯汀强调了其中一些测试的功能，所有这些测试都执行下一代测序，可以检测微卫星不稳定性（MSI）状态和肿瘤突变负担，并提供治疗建议。每个平台大约有300到600个基因序列，除了新的全球定位系统癌症测试，它有20000个基因序列。
“目前还不知道其中有多少是可以实际操作的，但在某些时候，我们可能需要这样的信息，”威斯汀说，德克萨斯大学安德森癌症中心妇科肿瘤和生殖医学系教授。
国家综合癌症网络指南指出，对于复发性卵巢癌、输卵管癌或原发性腹膜癌患者，建议在开始治疗持续性/复发性疾病之前进行肿瘤分子检测。此外，验证性试验应在临床实验室改良批准的设施中进行，使用最新可用的肿瘤组织，包括同源重组途径基因DEBCA1/2，而微卫星不稳定性（MSI）和/或DNA错配修复。
对组织的要求也在不同平台间相似这一点很重要，因为你必须知道你需要发送什么，以及这些公司需要生产多少纸巾才能取得好的效果。“大多数是10张左右的幻灯片，他们希望这些幻灯片中至少有20%的肿瘤。”
GPS癌症和Tempus xT平台提供生殖系筛选。威斯汀说，种系筛选很重要，因为它可以帮助医生确定基因突变是体细胞突变还是种系突变，并有助于识别其他可操作的突变。
“一般来说，如果突变是种系突变，那么对靶点没有帮助，”她说。“BRCAnotwithstanding，但是我们可以看到的大多数其他基因突变，如果我们知道[突变]在生殖系中，它可能不像我们希望的那样可行。”
在基因组分析后，患者可能也有资格接受PARP抑制作为治疗。Rucaparib（Rubraca）被批准用于brca阳性的晚期卵巢癌患者，这些患者在化疗前接受过≥2次化疗，olaparib（Lynparza）可作为治疗BRCA阳性晚期卵巢癌患者的一种药物，该药物在化疗前有3个或3个以上的疗程。
Niraparib（Zejula），olaparib，rucaparib被FDA批准为铂类化疗完全或部分缓解患者的维持治疗。
最近一次是在2018年12月，FDA批准奥拉帕利作为对一线铂类化疗有完全或部分反应的有害或疑似有害生殖系或生长激素突变的晚期上皮性卵巢癌、输卵管癌或原发性腹膜癌患者的维持治疗，经FDA批准的braclanalysis-CDx分析。
Westin指出卵巢癌是一种极其异质性的疾病，可以是浆液性、粘液性、子宫内膜样或透明细胞，以及其他许多特征。尽管如此，大多数患者都接受卡铂和紫杉醇治疗。基因组检测可以帮助该领域摆脱一刀切的做法。
“也许现在如果我们能够开始识别这些异常，我们可以开始对如何治疗这些患者变得更聪明一些，”她说。“目前有很多正在进行的试验，患者[有]低级别疾病，[我们正在研究]MEK抑制剂，[或]子宫内膜瘤患者正在研究PI3激酶途径抑制剂，因此它确实有助于我们获得这些试验，以便我们知道我们在处理什么。”
分子检测的另一个优势，她说，这可以推动临床试验的参与，特别是伞式和篮式试验。威斯汀在报告中引用了医学博士邓T.勒和同事在2015年《新英格兰医学杂志》上发表的一项研究。无论肿瘤类型如何，任何失配修复缺陷（dMMR）患者都有资格接受培溴珠单抗（Keytruda）。2研究结果发现，MMR缺陷的非直肠癌患者的反应与dMMR结直肠癌（CRC）患者的相似。
“是否有错配修复缺陷并不重要结肠直肠或非结肠直肠[癌症]，”她说。“如果他们有异常，他们是有好处的。”
这项研究的结果有助于2017年FDA批准彭布罗珠单抗治疗成人和儿童的不可切除或转移患者，MSI高或dMMR实体瘤，在先前治疗后进展，且没有令人满意的替代治疗选择，以及在氟嘧啶、奥沙利铂进展后MSI-H或dMMR CRC患者，而伊立替康。
在这些类型的试验中未经选择的检测可以发现那些预期不会对治疗产生反应的患者。威斯汀指出，40%的MSI高的患者出现在频率低于2%的肿瘤中。
“这些患者中的许多人不会有（畸变），但对于你确定的2%，他们会有影响，”她说。“这就是为什么未选择的测试可能有帮助。”
引用：
Westin，SN。PARPi在复发性卵巢癌中的作用及体细胞肿瘤的检测。在：2019年SGO冬季年会会议记录；2019年1月17-19日；Tahoe湖，CA.Le DT，Uram JN，Wang H等。PD-1阻断治疗错配修复缺陷肿瘤的临床研究。2015年；372（26）：2509-2520。内政部：10.1056/NEJMoa1500596
